Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAMEF14Q5SWL7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF14Q5SWL7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms