Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDLRAP1Q5SW96 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms