Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HP1BP3Q5SSJ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HP1BP3Q5SSJ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms