Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC39AQ5SRH9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC39AQ5SRH9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC39AQ5SRH9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC39AQ5SRH9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC39AQ5SRH9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC39AQ5SRH9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC39AQ5SRH9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC39AQ5SRH9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC39AQ5SRH9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC39AQ5SRH9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms