Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO47Q5MNV8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO47Q5MNV8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms