Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPECC1Q5M775 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms