Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD3Q5JSP0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD3Q5JSP0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD3Q5JSP0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms