Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMPK2Q5EBM0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms