Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms