Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLE1Q53GS7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLE1Q53GS7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms