Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZC2HC1CQ53FD0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZC2HC1CQ53FD0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZC2HC1CQ53FD0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZC2HC1CQ53FD0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms