Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAT3Q53EU6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPAT3Q53EU6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms