Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LIN52Q52LA3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIN52Q52LA3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms