Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRY2Q49AN0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRY2Q49AN0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms