Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP41Q3LFD5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP41Q3LFD5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms