Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P3H1Q32P28 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms