Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEACAM16Q2WEN9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM16Q2WEN9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms