Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC57Q2TAC2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC57Q2TAC2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC57Q2TAC2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC57Q2TAC2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC57Q2TAC2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC57Q2TAC2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC57Q2TAC2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC57Q2TAC2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms