Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q1T7F1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q1T7F1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q1T7F1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q1T7F1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q1T7F1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q1T7F1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q1T7F1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q1T7F1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q1T7F1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q1T7F1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q1T7F1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q1T7F1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q1T7F1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q1T7F1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q1T7F1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q1T7F1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q1T7F1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q1T7F1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q1T7F1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q1T7F1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q1T7F1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q1T7F1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q1T7F1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q1T7F1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q1T7F1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q1T7F1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q1T7F1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q1T7F1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q1T7F1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q1T7F1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q1T7F1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q1T7F1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q1T7F1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q1T7F1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q1T7F1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q1T7F1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q1T7F1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q1T7F1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q1T7F1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q1T7F1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q1T7F1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q1T7F1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q1T7F1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q1T7F1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q1T7F1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q1T7F1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q1T7F1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q1T7F1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q1T7F1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q1T7F1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q1T7F1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q1T7F1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q1T7F1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q1T7F1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q1T7F1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q1T7F1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q1T7F1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q1T7F1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q1T7F1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q1T7F1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q1T7F1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q1T7F1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q1T7F1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q1T7F1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q1T7F1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q1T7F1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q1T7F1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q1T7F1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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