Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC142Q17RM4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC142Q17RM4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC142Q17RM4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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