Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT16Q17RD7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT16Q17RD7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT16Q17RD7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT16Q17RD7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT16Q17RD7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT16Q17RD7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT16Q17RD7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT16Q17RD7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT16Q17RD7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT16Q17RD7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT16Q17RD7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYT16Q17RD7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT16Q17RD7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT16Q17RD7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT16Q17RD7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT16Q17RD7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT16Q17RD7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT16Q17RD7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT16Q17RD7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT16Q17RD7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT16Q17RD7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT16Q17RD7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT16Q17RD7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms