Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHQ16836 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHQ16836 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHQ16836 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHQ16836 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHQ16836 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHQ16836 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHQ16836 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHQ16836 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHQ16836 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHQ16836 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHQ16836 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHQ16836 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHQ16836 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHQ16836 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHQ16836 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHQ16836 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHQ16836 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHQ16836 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHQ16836 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHQ16836 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHQ16836 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHQ16836 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHQ16836 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHQ16836 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHQ16836 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HADHQ16836 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HADHQ16836 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHQ16836 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHQ16836 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHQ16836 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHQ16836 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHQ16836 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHQ16836 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHQ16836 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHQ16836 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHQ16836 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHQ16836 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHQ16836 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHQ16836 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHQ16836 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHQ16836 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHQ16836 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHQ16836 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHQ16836 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHQ16836 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHQ16836 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHQ16836 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHQ16836 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHQ16836 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHQ16836 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHQ16836 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHQ16836 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHQ16836 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHQ16836 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHQ16836 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHQ16836 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHQ16836 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHQ16836 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHQ16836 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHQ16836 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHQ16836 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHQ16836 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHQ16836 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHQ16836 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHQ16836 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHQ16836 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHQ16836 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHQ16836 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHQ16836 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHQ16836 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHQ16836 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHQ16836 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHQ16836 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHQ16836 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHQ16836 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHQ16836 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHQ16836 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHQ16836 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHQ16836 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHQ16836 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHQ16836 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHQ16836 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHQ16836 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHQ16836 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHQ16836 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHQ16836 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHQ16836 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHQ16836 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHQ16836 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHQ16836 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHQ16836 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHQ16836 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHQ16836 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHQ16836 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHQ16836 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHQ16836 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHQ16836 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHQ16836 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHQ16836 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms