Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPPQ16740 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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