Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK4Q16654 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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