Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TBR1Q16650 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBR1Q16650 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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