Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMN1Q16637 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
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