Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACKR1Q16570 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACKR1Q16570 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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