Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
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