Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPE65Q16518 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms