Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA6Q16445 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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GABRA6Q16445 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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GABRA6Q16445 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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GABRA6Q16445 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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