Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTRK3Q16288 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NTRK3Q16288 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NTRK3Q16288 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
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