Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFDHQ16134 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFDHQ16134 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ETFDHQ16134 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms