Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIP11Q15643 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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