Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF1Q15637 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF1Q15637 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF1Q15637 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF1Q15637 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF1Q15637 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF1Q15637 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF1Q15637 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF1Q15637 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF1Q15637 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF1Q15637 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF1Q15637 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF1Q15637 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF1Q15637 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF1Q15637 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF1Q15637 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF1Q15637 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF1Q15637 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF1Q15637 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF1Q15637 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF1Q15637 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF1Q15637 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF1Q15637 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF1Q15637 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF1Q15637 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF1Q15637 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF1Q15637 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF1Q15637 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF1Q15637 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF1Q15637 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF1Q15637 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF1Q15637 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SF1Q15637 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF1Q15637 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF1Q15637 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SF1Q15637 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SF1Q15637 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF1Q15637 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SF1Q15637 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF1Q15637 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF1Q15637 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF1Q15637 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF1Q15637 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF1Q15637 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF1Q15637 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SF1Q15637 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF1Q15637 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF1Q15637 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SF1Q15637 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF1Q15637 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF1Q15637 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF1Q15637 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SF1Q15637 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF1Q15637 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF1Q15637 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF1Q15637 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF1Q15637 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF1Q15637 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF1Q15637 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF1Q15637 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF1Q15637 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF1Q15637 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF1Q15637 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF1Q15637 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF1Q15637 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF1Q15637 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SF1Q15637 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF1Q15637 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF1Q15637 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF1Q15637 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF1Q15637 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF1Q15637 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF1Q15637 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF1Q15637 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF1Q15637 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF1Q15637 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF1Q15637 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF1Q15637 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SF1Q15637 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF1Q15637 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SF1Q15637 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF1Q15637 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF1Q15637 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF1Q15637 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF1Q15637 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF1Q15637 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF1Q15637 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF1Q15637 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF1Q15637 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF1Q15637 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SF1Q15637 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF1Q15637 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF1Q15637 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF1Q15637 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF1Q15637 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF1Q15637 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF1Q15637 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF1Q15637 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF1Q15637 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF1Q15637 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms