Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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SEC23BQ15437 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC23BQ15437 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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SEC23BQ15437 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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SEC23BQ15437 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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SEC23BQ15437 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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SEC23BQ15437 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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SEC23BQ15437 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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