Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB39AQ14964 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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RAB39AQ14964 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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RAB39AQ14964 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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RAB39AQ14964 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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RAB39AQ14964 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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RAB39AQ14964 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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RAB39AQ14964 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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RAB39AQ14964 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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RAB39AQ14964 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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RAB39AQ14964 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB39AQ14964 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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