Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCARF1Q14162 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARF1Q14162 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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