Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL9A2Q14055 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A2Q14055 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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