Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL9A3Q14050 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL9A3Q14050 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms