Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A6Q14031 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A6Q14031 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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