Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC2Q13868 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC2Q13868 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC2Q13868 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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