Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CACNA1SQ13698 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms