Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PMS2P11Q13670 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMS2P11Q13670 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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