Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF5Q13568 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF5Q13568 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
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