Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BFSP2Q13515 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BFSP2Q13515 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BFSP2Q13515 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BFSP2Q13515 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BFSP2Q13515 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BFSP2Q13515 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BFSP2Q13515 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BFSP2Q13515 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BFSP2Q13515 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms