Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRSQ13332 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRSQ13332 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRSQ13332 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRSQ13332 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRSQ13332 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRSQ13332 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRSQ13332 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRSQ13332 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRSQ13332 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRSQ13332 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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