Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 LINC00339-210ENST00000635675 1404 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.563e-16■■■■■ 34.8
PABPC4Q13310 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.543e-14■■■■■ 34.8
PABPC4Q13310 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.671e-7■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.63e-7■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.598e-7■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.238e-7■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 TACC1-206ENST00000519093 6447 ntTSL 1 (best)8.64□□□□□ -1.038e-7■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.411e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.161e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.111e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.091e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.051e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 ACY1-221ENST00000637199 790 ntTSL 219.98■□□□□ 0.791e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 ACY1-209ENST00000491318 1390 ntTSL 319.4■□□□□ 0.71e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.681e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 ACY1-218ENST00000637034 745 ntTSL 318.78■□□□□ 0.61e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 ACY1-226ENST00000637746 685 ntTSL 218.78■□□□□ 0.61e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 ACY1-217ENST00000636880 1457 ntTSL 318.65■□□□□ 0.581e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 ACY1-229ENST00000638136 1857 ntTSL 518.07■□□□□ 0.481e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 ACY1-208ENST00000490244 812 ntTSL 215.66■□□□□ 0.11e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 ACY1-227ENST00000638077 456 ntTSL 210.79□□□□□ -0.681e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 CSTF1-201ENST00000217109 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 CSTF1-206ENST00000493039 2234 ntTSL 510.81□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 04e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.124e-10■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 11e-6■■■■■ 34.7
PABPC4Q13310 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.642e-11■■■■■ 34.6
PABPC4Q13310 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 34.6
PABPC4Q13310 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 34.6
PABPC4Q13310 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 34.6
PABPC4Q13310 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 34.6
PABPC4Q13310 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.584e-10■■■■■ 34.6
PABPC4Q13310 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.44e-10■■■■■ 34.6
PABPC4Q13310 EIF2B3-204ENST00000439363 892 ntTSL 37.81□□□□□ -1.164e-10■■■■■ 34.6
PABPC4Q13310 EXOC4-208ENST00000468932 753 ntTSL 314.2□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 34.6
PABPC4Q13310 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 34.6
PABPC4Q13310 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.448e-7■■■■■ 34.6
PABPC4Q13310 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 34.6
PABPC4Q13310 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.028e-7■■■■■ 34.6
PABPC4Q13310 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.067e-7■■■■■ 34.6
PABPC4Q13310 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.492e-8■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 RPL15-209ENST00000436146 1990 ntTSL 57.68□□□□□ -1.187e-14■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.265e-9■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.265e-9■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 SAT1-208ENST00000487713 432 ntTSL 210.96□□□□□ -0.655e-9■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.243e-19■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 MYL12A-207ENST00000579226 947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.243e-19■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 MYL12A-201ENST00000217652 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.483e-19■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.193e-19■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.193e-19■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 27e-33■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 SENP3-209ENST00000610454 606 ntTSL 316.09■□□□□ 0.177e-33■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.057e-33■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 SENP3-205ENST00000581010 527 nt8.51□□□□□ -1.057e-33■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 SENP3-206ENST00000581093 493 ntTSL 57.44□□□□□ -1.227e-33■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 RHOA-203ENST00000422781 961 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.449e-13■■■■■ 34.5
PABPC4Q13310 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.174e-7■■■■■ 34.4
PABPC4Q13310 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 34.4
PABPC4Q13310 BUD23-213ENST00000463307 1815 ntTSL 1 (best)16.01■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 34.4
PABPC4Q13310 BUD23-209ENST00000436944 2496 ntTSL 215.84■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 34.4
PABPC4Q13310 BUD23-207ENST00000430446 738 ntTSL 315.57■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 34.4
PABPC4Q13310 BUD23-211ENST00000442099 691 ntTSL 315.13■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 34.4
PABPC4Q13310 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.342e-9■■■■■ 34.4
PABPC4Q13310 ATP5D-203ENST00000588538 1393 ntTSL 1 (best)22.92■■□□□ 1.262e-9■■■■■ 34.4
PABPC4Q13310 ATP5D-205ENST00000590265 1144 ntTSL 1 (best)21.95■■□□□ 1.12e-9■■■■■ 34.4
PABPC4Q13310 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.12e-9■■■■■ 34.4
PABPC4Q13310 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.522e-9■■■■■ 34.4
PABPC4Q13310 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.66e-6■■■■■ 34.4
PABPC4Q13310 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.421e-6■■■■■ 34.3
PABPC4Q13310 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 34.3
PABPC4Q13310 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 34.3
PABPC4Q13310 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 34.3
PABPC4Q13310 MFSD14B-202ENST00000428393 2275 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 34.3
PABPC4Q13310 SSR4-211ENST00000486204 658 ntTSL 315.23■□□□□ 0.039e-9■■■■■ 34.3
PABPC4Q13310 SSR4-210ENST00000485612 701 ntTSL 215.23■□□□□ 0.039e-9■■■■■ 34.3
PABPC4Q13310 DCTN2-201ENST00000434715 1677 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.293e-9■■■■■ 34.3
PABPC4Q13310 DCTN2-209ENST00000548249 2061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 34.3
PABPC4Q13310 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.181e-13■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 AL139011.2-202ENST00000485079 914 ntTSL 311.38□□□□□ -0.591e-13■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 PEX19-205ENST00000472750 3504 ntTSL 1 (best)9.75□□□□□ -0.851e-13■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 PEX19-204ENST00000467711 205 ntTSL 39.68□□□□□ -0.861e-13■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.081e-13■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.851e-10■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.046e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 PYM1-202ENST00000398213 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.446e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.295e-15■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.936e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.876e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 PPAN-204ENST00000444703 757 ntTSL 331.38■■■□□ 2.616e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 PPAN-208ENST00000486482 1017 ntTSL 230.22■■■□□ 2.436e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.312e-6■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.263e-6■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.263e-6■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.156e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.16e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 EMC10-207ENST00000599293 1926 ntTSL 327.61■■■□□ 2.013e-6■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 EMC10-208ENST00000601780 2178 ntTSL 1 (best)27.16■■□□□ 1.943e-6■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.796e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 PACSIN3-205ENST00000528462 1560 ntTSL 225.56■■□□□ 1.686e-8■■■■■ 34.2
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