Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME3Q13232 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME3Q13232 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME3Q13232 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME3Q13232 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME3Q13232 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME3Q13232 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME3Q13232 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NME3Q13232 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NME3Q13232 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NME3Q13232 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME3Q13232 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME3Q13232 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NME3Q13232 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME3Q13232 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME3Q13232 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME3Q13232 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME3Q13232 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME3Q13232 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME3Q13232 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME3Q13232 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NME3Q13232 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME3Q13232 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NME3Q13232 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NME3Q13232 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME3Q13232 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME3Q13232 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME3Q13232 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME3Q13232 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME3Q13232 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME3Q13232 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME3Q13232 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME3Q13232 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME3Q13232 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME3Q13232 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME3Q13232 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME3Q13232 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME3Q13232 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME3Q13232 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NME3Q13232 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME3Q13232 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME3Q13232 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME3Q13232 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME3Q13232 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME3Q13232 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME3Q13232 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME3Q13232 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME3Q13232 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME3Q13232 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME3Q13232 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME3Q13232 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME3Q13232 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME3Q13232 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME3Q13232 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME3Q13232 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME3Q13232 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME3Q13232 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME3Q13232 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME3Q13232 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME3Q13232 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME3Q13232 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME3Q13232 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NME3Q13232 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NME3Q13232 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME3Q13232 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME3Q13232 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME3Q13232 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME3Q13232 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME3Q13232 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME3Q13232 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME3Q13232 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME3Q13232 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME3Q13232 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME3Q13232 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME3Q13232 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME3Q13232 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NME3Q13232 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NME3Q13232 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NME3Q13232 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME3Q13232 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME3Q13232 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME3Q13232 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME3Q13232 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME3Q13232 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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