Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIA1Q13136 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA1Q13136 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA1Q13136 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
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