Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHAF1BQ13112 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1BQ13112 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1BQ13112 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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